вищий керівний орган – зліт, який скликається за рішенням Національної ради не рідше одного разу на п'ять років;

керівний орган на період між зльотами – Національна рада дитячих організацій України, яка складається з двох палат: дитячої та дорослої, які збираються не рідше одного разу в рік

Дитяча палата – постійно діючий збір. У період між зльотами кількісний і персональний склад дитячої палати може змінюватись і є непостійним

Палата дорослих – пленум, склад якого є фіксованим: від кожної Організації-члену Федерації обирається по три особи і п'ять осіб обирає пленум

постійно діючий виконавчий орган Національної ради – бюро Національної ради, членами якого є Голова Національної ради, заступники голови, голови керівних органів Організацій-членів Федерації та інші особи зі складу Національної ради за її рішенням. Бюро очолює Голова Національної ради